南通瑞慈兒童醫(yī)院承擔著重要的醫(yī)療及教學任務(wù)。醫(yī)院由兒內(nèi)科、兒外科、兒童保健科、兒童急救中心組成。兒內(nèi)科為南通市臨床重點學科，南通市科研重點專科，南通市護理重點?？?。同時瑞慈兒童醫(yī)院加入國家兒童醫(yī)學中心長三角兒童重癥聯(lián)盟、兒童消化?？坡?lián)盟，兒童神經(jīng)專科聯(lián)盟。

    瑞慈兒童醫(yī)院專業(yè)齊全。兒內(nèi)設(shè)有新生兒、呼吸、急救、心血管、消化、內(nèi)分泌、腎臟、血液、神經(jīng)等專業(yè)；兒外科設(shè)有小兒普外、胸外、骨科、泌尿及新生兒等專業(yè)，許多較復(fù)雜的手術(shù)采用目前國內(nèi)、國際最新手術(shù)方式在南通地區(qū)甚至蘇北地區(qū)首次開展。兒童保健科重點開展兒童保健、早教、腦癱康復(fù)，同時還開展智力測定、心理咨詢等項目。兒童急救中心建設(shè)有監(jiān)護轉(zhuǎn)運機制及各市縣兒童急救網(wǎng)絡(luò)，提高了危重患兒搶救成功率。

    瑞慈兒童醫(yī)院各二級學科帶頭人來自于全國各地知名三甲醫(yī)院，部分優(yōu)秀技術(shù)人才入選為江蘇省“333”工程、南通市“226”工程、南通市“335”工程人才，并分別擔任了國家級、省級、市級醫(yī)學會各專業(yè)分會及學組的主任委員、副主任委員、秘書、委員等職務(wù)。人才梯隊完善，專業(yè)技術(shù)力量雄厚。

    瑞慈兒童醫(yī)院一方面加強與國際、國內(nèi)多家著名醫(yī)院長期合作,如加拿大東安大略省兒童醫(yī)院、韓國三星醫(yī)院、復(fù)旦大學附屬兒科醫(yī)院，醫(yī)療資源共享；另一方面注重與基層醫(yī)院聯(lián)系，定期派醫(yī)療隊伍支持、指導基層醫(yī)院醫(yī)療工作，并積極開展繼續(xù)教育、在職培訓，為提高南通地區(qū)醫(yī)療水平而努力。同時重視兒童疾病預(yù)防及管理，成立了系列健康教育學校，如哮喘學校、健康保健講座等，受到了廣大患兒家屬的歡迎。

    瑞慈兒童醫(yī)院硬件設(shè)施國內(nèi)一流，院內(nèi)配備完善的計算機網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，所有部門全部實行信息化管理，配備有美國AIR-SHIELDS ISOLETTE保暖箱，進口嬰兒輻射搶救臺（帶搶救型呼吸機），進口太空艙監(jiān)測儀，PB8400呼吸機等進口先進設(shè)備；醫(yī)院內(nèi)病房設(shè)置合理，每間病房均有單獨的衛(wèi)生間和洗浴設(shè)施，24小時供應(yīng)冷熱水，電視、電話設(shè)施齊全；設(shè)有兒童活動室及室外活動場所，并有志愿者指導患兒學習，陪同患兒游戲。凡此種種使就診者置身于高水準、專業(yè)化的良好氛圍。

     針對患者的不同需求，瑞慈兒童醫(yī)院設(shè)有國際部，提供一對一診療服務(wù)及家庭病房，在醫(yī)療護理、安全性和私密性等方面與國際接軌，為患兒提供高端的醫(yī)療服務(wù)。

     瑞慈醫(yī)院作為專業(yè)的兒童醫(yī)院，將繼續(xù)在臨床醫(yī)療質(zhì)量管理、重大疾病診治及搶救綠色通道的建立、信息化管理、醫(yī)院網(wǎng)絡(luò)建設(shè)、人才培養(yǎng)、科研項目與人員管理、醫(yī)院對外宣傳與合作交流等方面不斷推出一系列新的舉措，以一流的人才、一流的技術(shù)、一流的設(shè)施、一流的環(huán)境為廣大患者提供一流的服務(wù)。